晶体学构建的亚微观世界
这篇《Nature Protocols》旨在帮助X射线晶体学科学家避免无意中损害研究工作的潜在陷阱。
X射线晶体学所揭示的物质远比传统光学显微镜观察到的小得多。它类似声呐装置,科学家用X射线轰击分子,然后测量X射线反弹时的角度(衍射),利用这些信息计算目标物质的形状。
这是一项非常复杂的任务,在许多环节都会出错。弗吉尼亚大学医学院Wladek Minor博士领导的研究小组创建新指南的目标就是防止错误情况发生。
“编写蛋白或病毒中金属结合位点精确表征最佳操作指南和汇编潜在陷阱并非易事,这需要来自不同领域的许多研究者的多年经验和努力,”Minor说。“我希望,我们的研究能提高大家处理含金属样品等研究的质量和可靠性,最终促进学术和商业研究的可重复性。”
Wladek Minor指出,金属对许多生物和细胞过程起重要作用,“例如,在人类循环系统中,”他说。“血清蛋白运输锌,血红蛋白所含的铁帮助红细胞将氧气输送给全身细胞,而镁是许多酶的组成部分。”
此外,目前还有一类完全基于金属的抗癌药物。因此,准确理解人体与金属的相互作用能解决很多问题。
“蛋白质和核酸金属结合位点错误识别和/或误释会阻碍信息的解读,对未来研究具有潜在不良影响,”文章共同作者张和平(Heping Zheng)说。“从事金属药物研发的生物学家、药理学家和科学家应该能从我们的这项研究中受益。”
答魔社区整理:
原文:Characterizing metal-binding sites in proteins with X-ray crystallography
DOI号:10.1038/nprot.2018.018
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