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Cell:80后MIT合成生物学副教授开辟免疫治疗新方法

卢冠达博士团队借助合成生物学思想,设计了一个可以通过病毒进入癌细胞内部,并识别癌细胞邪恶内心的「基因电路」。这个基因电路产生大量免疫信号因子,激活免疫系统,招募免疫细胞杀敌。

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坏人一般不会把「坏」字写在脸上。癌细胞也是。

坏人不仅不会把「坏」字写在脸上,还会释放各种烟幕弹,制造自己是好人的假象。癌细胞也是。

这是当下大热的免疫检查点抑制剂和CAR-T治疗只对有限的癌症患者有效的原因之二。如何解决这两个问题,也是当下免疫治疗领域研究的热点。

MIT电气工程和计算机科学学院与生物工程学院副教授,素有「合成生物学领域思想家」的卢冠达(Timothy K. Lu)博士团队最近也在思考也这个问题。在他们看来,无论癌细胞外表再怎么光鲜,再怎么像正常细胞,它们的内心肯定是邪恶的。既然免疫细胞「看脸」不能很好的识别癌细胞,那么我们就把癌细胞的黑心掏给免疫细胞看。

640.webp.jpg「合成生物学领域思想家」、跨界达人卢冠达(Timothy K.Lu)

于是,卢冠达借助自己的合成生物学思想,设计了一个可以通过病毒进入癌细胞内部,并识别癌细胞邪恶内心的「基因电路」。这个基因电路很特殊,在那些控制只在癌细胞内的基因表达的转录因子的刺激下,迅速开启,产生大量免疫信号因子,激活免疫系统,招募免疫细胞杀敌。

通俗的说,就是卢冠达团队设计的这个基因电路,不仅能够专门识别癌细胞,而且在识别癌细胞之后还会「大声叫喊」,叫醒免疫系统,喊来免疫细胞。

在对卵巢癌模型小鼠进行的实验中,基因电路取得了非常好的效果,与对照组小鼠相比,实验组小鼠体内的癌细胞几乎全被消灭了!而且如同理论,正常细胞丝毫没有受到影响。

近日,顶级期刊《细胞》杂志就刊登了卢冠达团队的这一重要研究成果[1]。

640.webp (1).jpg左:不处理的卵巢癌小鼠

中:增加了癌症特异性抗原的卵巢癌小鼠

右:使用基因电路的卵巢癌小鼠

同时,这种基因电路采用了模块化的设计,就像乐高积木一样,可以根据实际需求替换关键元件。这意味着它不光能随时「升级换代」,换个识别标记就能用来治疗其他癌症甚至免疫疾病。

那基因电路到底是什么呢?

大家在初中物理一定都学过简单电路,开关控制着小灯泡的明灭。所谓的“基因电路”倒不是真的电路,它是一组按照一定逻辑编辑的基因,分为「开关」——启动子(promoter)和「灯泡」——工作元件(circuit component)。这些工作元件一般来说是一些编码蛋白质的基因。当达成某些条件,这组基因电路的启动子被激活,调控工作元件表达,就能够实现研究者想要的生物功能。

640.webp (2).jpg理科生们,看这题你们还会吗

看上去也没啥特别的啊,不是早就有研究者做出了能靶向癌细胞的基因电路了吗[2]?卢冠达团队带来的这个基因电路优秀之处在于,一是利用转录因子对癌细胞进行识别,更加精准、应用更加广泛;二是,这是首次把基因电路用在增强免疫反应上。

卢冠达博士年纪轻轻已经站上合成生物学领域高点的80后男神,目前是麻省理工学院合成生物学研究小组负责人。他拥有着计算机、电气工程、合成生物学、医学多方面的知识背景,或许正是得益于这种广阔的视角,他才能大胆地玩跨界,而且屡屡获得成功。

640.webp (3).jpg男神对生物膜也特有研究

在理想条件下,免疫治疗应该识别那些只表达在癌细胞表面的细胞表面抗原,以免误伤正常细胞,但实际上,这种高专一性的抗原非常难找[3]。除此之外,肿瘤还会利用一些特殊的位点(例如PD-1)来抑制免疫反应,大模大样地逍遥法外。

现在临床上常常使用一些具有免疫调节作用的因子,例如细胞因子、趋化因子和免疫检查点抑制剂,来增强免疫系统的功能,以期望能翻越这两座大山。但是这又带来了另外的问题——免疫系统的功能是增强了,但也对一些意料之外的新位点产生了作用,连健康的组织也一并干掉了,这在临床实验上导致了严重的副作用[4,5]。

于是卢冠达副教授就想啊,要是能找到新方法,简单快捷地抓住癌细胞的同时,直接在它身上产生免疫调节因子,这些问题不就都解决了吗。

640.webp (4).jpg诸位读者还真别笑这个想法是「给猫系铃铛」,基因电路可不就实现它了嘛。

大家都知道,癌细胞疯狂增殖,它们的基因表达水平是远超正常细胞的。抓住了这个特点,卢冠达团队把转录因子(TFs)作为癌症的标志物,设计了能识别它们的启动子。比起找个癌细胞表面抗原,找特定癌细胞的转录因子可容易多了。

为了更精准地识别癌细胞,研究者在基因电路上安装了两个不同的启动子,做了一个「与门」结构。只有两个启动子都认为「有肿瘤!」,整个基因电路才会运作。

从理论上来看,这套基因电路对健康细胞毫无威胁,对癌细胞却是灭顶之灾。因为一旦发现了癌细胞,基因电路运作,就会产生多种免疫因子,激活免疫系统,把癌细胞「一窝端了」。这套基因电路能产生的因子包括:表面T细胞结合子(STE),一种细胞表面抗原,是癌细胞的特异性识别位点;趋化因子21(CCL21),可以促进T细胞在癌细胞位点聚集;白介素12(IL12),一种可以增强T细胞活性和功能的细胞因子;PD-1抗体,能够降低癌细胞对免疫系统的抑制。

任你癌细胞再怎么狡猾,这四种免疫激活因子分别作用于免疫反应的不同环节,全方位围剿坏蛋。

640.webp (5).jpg两个启动子都识别到肿瘤标志物,基因电路启动,释放多种免疫激活因子,吸引免疫细胞聚集、促进对癌细胞的杀伤、避免免疫抑制,这种过程对健康细胞毫无伤害

「我们认为,现在首要的是对肿瘤位点进行精准的免疫打击,而不是对整个机体系统的治疗,」卢冠达副教授如是说,「其次,我们想要一次性产生多种免疫调节剂,这样能够从多种角度调节免疫系统。」

在体外、体内实验中,研究者们确实也达到了预想的效果。结果显示,基因电路能够“分辨”癌细胞和健康细胞,引导免疫系统精准攻击癌细胞,毫不影响其他非致癌性的健康细胞,对癌细胞的杀灭效果也非常好。

研究者们认为这项研究还有很多不足的地方,主要是实验中使用到的癌细胞和T细胞都来自人类,宿主则是小鼠,这在一定程度上限制了对安全性和有效性的评价。不过他们已经定好了下一步目标,将在其他几种模式动物上重复实验,以得到更可靠的数据。

另外就是实验中使用了慢病毒作为基因电路的载体,只有15%的癌细胞中有正常工作的基因电路。将来他们会尝试其他的载体,提高转化效率,如溶瘤病毒

目前卢冠达团队进行了卵巢癌相关的实验,还成功合成了乳腺癌相关的启动子。研究者表示,他们计划在一系列癌症中测试基因电路的威力,最终还有希望使用基因电路治疗其他免疫相关疾病,如风湿性关节炎、炎症性肠病和其他自身免疫性疾病。

参考资料:

[1]http://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(17)31143-1

[2] Liu, Y., Zeng, Y., Liu, L., Zhuang, C., Fu, X., Huang, W., and Cai, Z. (2014). Synthesizing AND gate genetic circuits based on CRISPR-Cas9 for identification of bladder cancer cells. Nat. Commun. 5, 5393.

[3] Klebanoff, C.A., Rosenberg, S.A., and Restifo, N.P. (2016). Prospects for gene-engineered T cell immunotherapy for solid cancers. Nat. Med. 22, 26–36.

[4]Lasek, W., Zagozd_ zon, R., and Jakobisiak, M. (2014). Interleukin 12: still a _promising candidate for tumor immunotherapy? Cancer Immunol. Immunother.63, 419–435.

[5]Lengyel, E., Burdette, J.E., Kenny, H.A., Matei, D., Pilrose, J., Haluska, P.,Nephew, K.P., Hales, D.B., and Stack, M.S. (2014). Epithelial ovarian cancer experimental models. Oncogene 33, 3619–3633.


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