3.5%还在对照组的范畴，可以视为control。是不是加药浓度太低了。

3.5%太低了，都可以认为是空白对照了。如果有假阳性这一说的话，这个结果还在假阳性范畴。如果认为有效的话，起码也要凋亡10%左右吧，高浓度或者两药联用的话应该更高。体外细胞毒性没有做吗？起码两者在细胞生存比率上结果应该是接近的。

这个好像没有规定，一般认为空白对照的凋亡比率在5%以内，对应的细胞生存率约95%。药物有效的话癌细胞肯定要死，如果加药和不加药两者只有3%的差距，那这也太小了，还不如放弃治疗。给你举个例子：如果是细胞毒性药物加药处理的话，细胞生存率低于90%可视为有效，死亡的细胞包括凋亡和坏死的部分，共计10%左右，其中又以凋亡为主（5%~10%）。作用24h的话，如果药效特别明显，细胞生存率可能在70%左右或者更低，即使坏死和凋亡各占一半，凋亡比例也肯定要超过10%了。处理12h检测凋亡的话时间肯定是足够了，应该是药物浓度太低了，你不妨试试加大浓度。抗癌药物的细胞凋亡检测4h就可以检测到。

测凋亡我个人觉得12h，24h就足够了，48h坏死的比例就高了。你最好预实验一下，多设置几个浓度，如果12h检测不方便的话可以24h，凋亡检测起来也很方便，结果也很直观，如果坏死的比例过高建议还是缩短时间。3.5%的这个结果可以舍弃了。