一、固相合成某多肽(比如AABBCCDDEE):法一:从羧基端的E开始,合成到氨基端的A。法二:将序列反过来写EEDDCCBBAA,从羧基端的A开始,合成到氨基端的E。请问如此两种方法得到的多肽,空间构象完全一致吗,是否合成的方向不同会产生影响?二、将蛋白多肽经PEG修饰,如果完全在DMF(二甲基甲酰胺)介质体系中反应是否会对蛋白多肽的空间构象产生不可逆的影响。见过有文描述“DMF(二甲基甲酰胺)作为高浓度膜变性剂能通过破坏多肽的二级结构而助溶。”不知这个影响是否可逆?
我以前做过这方面谈一点感觉1.这点可从生化关于蛋白质和多肽的命名中查找,确保合成序列完全一致,我以前合成过六十个以下氨基酸的多肽,空间构象没有问题。如果序列很长在有二硫键及氢键的作用有不同的 空间构象
2.不会影响其活性,在合成过程中DMF只是让多肽尽量舒展不蜷曲,把它从DMF中取出后就会恢复其自然状态,就如把老虎关在笼子里,只是限制他并不改变它,打开笼子老虎还会吃人。我们做过一百五十多个氨基酸的多肽都是在DMF状态下合成,最终都很好。我们合成过几百条多肽还没有出现您所说的情况。