已知目的基因的启动子序列,想在特定信号通路下游寻找一个转录因子,有什么软件可以实现吗?多谢多谢!要比较精确的
启动子数据库里有的,不过把目标定成1个转录因子,是很难的,要多选几个因子来筛,成功概率大一点。
以用consite 、jaspar等软件预测转录因子,确定了转录因子可以做一个双荧光报告检测或者ChIP实验验证你的预测是否正确
你的目的是预测转录因子,既然已经知道了启动子序列,用启动子序列就行了,要是不放心,可以前后再加一些序列信息去预测