虽说各有用处，不过NMR肯定比IR用途广泛的多。理论上面的姑且不说。实际操作时样品很重要，分子量小的NMR基本上没有问题，如果是大分子量的样品，例如几百万分子量的多糖，连溶解都很难，即使碳谱都不一定做的出的东西，这个时候红外就很好用了。

IR是根据振动中伴随有偶极矩变化的（没有偶极矩变化的振动在拉曼光谱中出现）。因此，除了单原子和同核分子如Ne、He、O2、H2等之外，几乎所有的有机化合物在红外光谱区均有吸收。除光学异构体，某些高分子量的高聚物以及在分子量上只有微小差异的化合物外，凡是具有结构不同的两个化合物，一定不会有相同的红外光谱。红外吸收带的波数位置、波峰的数目以及吸收谱带的强度反映了分子结构上的特点，可以用来鉴定未知物的结构组成或确定其化学基团；而吸收谱带的吸收强度与分子组成或化学基团的含量有关，可用以进行定量分析和纯度鉴定。由于红外光谱分析特征性强，气体、液体、固体样品都可测定，并具有用量少，分析速度快，不破坏样品的特点。因此，红外光谱法不仅与其它许多分析方法一样，能进行定性和定量分析，而且是鉴定化合物和测定分子结构的用效方法之一。很多不是NMR能解决的。

红外和NMR是互补的两种东西，各有所长不能互相替代。一般情况下NMR是主要的；红外是也是不可缺少的。NMR常用来测定碳-碳连接的关系、碳氢连接关系，也就是样品的骨架和构型。红外提供的主要是官能团信息，这两个是相辅相成的。当然还有其他一些测试手段，各有所长。