CE-SDS和SDS-PAGE都是用于检测蛋白纯度的电泳方法，药典也都有记载，算很常规的操作。

但是最近我在做一个蛋白（无糖基化）纯度分析时就发现了这么个问题。还原（红色）和非还原（蓝色）CE-SDS结果见下图，我这里已经把蛋白提高到20 g/L，最终上样的浓度是5 g/L。积分下来纯度都是100%，出峰时间几乎一样。也就是说，还原和非还原分子量一样，而且没看到杂带。

下面这个是SDS-PAGE结果，从左到右依次为3个还原操作，Marker，3个非还原操作。点样浓度10ug/孔。胶浓度10%。

两个一对比就发现问题了，第一CE-SDS的纯度是100%，是怎么改积分参数都没有其他峰积出来，而SDS-PAGE结果扫描软件就能扫到杂带，非还原有部分聚体，还原有一些低分子量的。第二是SDS-PAGE怎么非还原的分子量要比还原的要小？而CE-SDS是两个出峰时间是一样的。

针对第一个问题，这是CE的灵敏度没有SDS-PAGE高吗？还是SDS-PAGE的杂带是前处理反应产生的？因为这个方法也经常跑其他单抗项目的CE-SDS，NGHC和HC这种分子量只差几道尔顿的都能分离，SDS-PAGE得到的杂带比主条带都要差10道尔顿以上了，理论上对CE应该是能分离出来的。

针对第二个问题，我这边前处理条件都是一样的，仅仅是buffer不同，CE-SDS用的是贝克曼里面的buffer，SDS-PAGE的loading buffer是根据药典配的。这些参数和buffer平时跑单抗没什么问题的，分子量都是对的，杂带也基本和CE-SDS对的上。而这次SDS-PAGE只有还原条带分子量和理论是一样的，非还原条带少了将近10道尔顿。

请教各位大神，这怎么解释，我该信哪个的结果？