转录组，主要想看基因表达。基因表达主要是mR N A，成熟m R N A尾巴有多聚A，所以用polyT来富集它。(还因为R N A中大部分是核糖体R N A，m R N A及lncRNA只是一小部分，所以要富集。)

你的图是两个路线，两个实验要分开做的。第一个如上所述富集的是mRNA。第二个是获得去核糖体RNA，里面包含了mRNA、lncNRA、smallRNA、cir-RNA。如果仅看mRNA的变化，采用第一种路线富集mRNA，如果想得到更多的数据进行分析，选择第二种去核糖体RNA的做法。

一般的RNA-seq指的是mRNA测序。由于真核生物的mRNA具有polyA尾巴，而用通用方法如trizol等提取出来的是全部的RNA，其中核糖体RNA占据绝大部分。因此需要对其进行纯化。真核生物一般采用polyT来富集沉淀（也称polyA富集）。原核生物的mRNA由于没有polyA尾巴，一般采用去核糖体试剂盒的方式。当然真核也可采用试剂盒方式去处核糖体RNA