2024-11-11 10:15:05

超声波破碎有什么具体的要求吗?

最近在做一个异源表达蛋白的纯化,在进行超声波破碎时,总是破碎的不好,破碎离心后还是会有很多的细胞沉淀,不知道超声波破碎有什么具体的要求吗?我用的是中等功率400w,90次,每次超5秒,停5秒。细胞是BL21。 另外,我超的时候老是会有泡沫出现,怎样才能很好的防止泡沫出现,听有的人说泡沫一出现蛋白就变性了,不能做后期的酶活实验了。请高手指点啊!!


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蛋白质组学×

11个回答

超声后有点沉淀是可以理解的,异源蛋白在BL21表达时由于表达量比较高,很可能是有一部分以可溶形式存在,还有一部分是包涵体的形式存在,超声后细胞碎片以及包涵体经离心后会沉下。如果你的包涵体比较多,这个沉淀的量还是很可观的。你的破壁条件是很常用的,一般为了保护机器都是要间歇性的超声,5/5用的很多。100次(16.7min)也足够了,但不同的菌株可能有不同,我以前做的几个菌株从10min到25min都有,但一般而言,如果你的蛋白不是是包涵体,建议超声时间不宜太长,机械剪切力的影响必须考虑进去。给你举个例子,我在做一个蛋白时超声时间设定在25min,吵完后12000rpm×10min结果什么东西都离不下来,但PAGE发现其实很多蛋白都已经降解了,整个条带像火箭电泳一样。超声时注意的因素也就那么几个。(1)首先是必须低温,可以采用冰浴的方法控制温度。(2)超声量不要太多,这个要自己去摸索,一定功率下的超声体积太大很容易破壁不完全。(3)菌体浓度不要太高,沉淀后的菌体重悬时控制好比例。超声时有泡沫出现的确不是件好事,很可能部分蛋白已经变性失活,但也并不像你想象的那样蛋白酶活就全没有了,可以测定一下还剩多少。超声时出现泡沫的控制方法我没有专门试过,但我想两个条件控制好应该会减轻这个现象。(1)控制超声时间,不要无意义的延长时间;(2)变辐杆下端深入液面以下多少要合适,太多太少都不行。其实超声条件的摸索还是一件比较简单的事情的,你可以取适量的菌液,设定功率,间隔不同的时间取样,革兰染色检测破碎效果,从而确定超声工艺,这是最简单的办法,也是最可行的办法。


2024-11-11 10:41:09

间隔时间长一点会好一点吧

2024-11-11 10:45:59

我觉得应该适当减小功率,增大间隔时间,并且在冰上处理,可以减少气泡的产生


2024-11-11 10:54:44

超声破碎时,一个是探头深入液面的长度,一般深入液面以下不长于0.5cm;一个是超声破碎菌液的体积和液体的表面积,液体的表面积太小而探头又很大,很容易起泡沫;功率400W适中,如果体积小的话,还可以降低下功率,延长工作时间即可。如果仍不凑效,那就采用merck的bugbuster裂解液吧,得到的蛋白一般不会在蛋白抽提的时候变性。


2024-11-11 10:56:52

超声后有点沉淀是可以理解的,异源蛋白在BL21表达时由于表达量比较高,很肯能是有一部分以可溶形式存在,还有一部分是包涵体的形式存在,超声后细胞碎片以及包涵体经离心后会沉下。如果你的包涵体比较多,这个沉淀的量还是很可观的。你的破壁条件是很常用的,一般为了保护机器都是要间歇性的超声,5/5用的很多。100次(16.7min)也足够了,但不同的菌株可能有不同,我以前做的几个菌株从10min到25min都有,但一般而言,如果你的蛋白不是是包涵体,建议超声时间不宜太长,机械剪切力的影响必须考虑进去。给你举个例子,我在做一个蛋白时超声时间设定在25min,吵完后12000rpm×10min结果什么东西都离不下来,但PAGE发现其实很多蛋白都已经降解了,整个条带像火箭电泳一样。超声时注意的因素也就那么几个。(1)首先是必须低温,可以采用冰浴的方法控制温度。(2)超声量不要太多,这个要自己去摸索,一定功率下的超声体积太大很容易破壁不完全。(3)菌体浓度不要太高,沉淀后的菌体重悬时控制好比例。超声时有泡沫出现的确不是件好事,很可能部分蛋白已经变性失活,但也并不像你想象的那样蛋白酶活就全没有了,可以测定一下还剩多少。超声时出现泡沫的控制方法我没有专门试过,但我想两个条件控制好应该会减轻这个现象。(1)控制超声时间,不要无意义的延长时间;(2)变辐杆下端深入液面以下多少要合适,太多太少都不行。其实超声条件的摸索还是一件比较简单的事情的,你可以取适量的菌液,设定功率,间隔不同的时间取样,革兰染色检测破碎效果,从而确定超声工艺,这是最简单的办法,也是最可行的办法。


2024-11-11 10:59:23

我以前超声破碎菌液也是特别容易起泡沫,后来调整好探头深入液面的位置就好多了,一般把探头深入到液面以下1/3的位置,超声1s停止10s,作用2min,然后隔15min再重复上面的操作,如此重复5次,这样间歇性的超声,效果还是不错的,尽管有点麻烦

2024-11-11 11:00:17

 1、超声时要在冰浴下进行;2、超声功率与容器的内径有很大关系:内径小,所需功率也小,不易引起气泡;反之则可能致使蛋白变性;3、超声前加些蛋白酶抑制剂有利于保护目的蛋白的活性;4、超声时间5',间隙15-20',总时间20 min左右


2024-11-11 11:01:20

超声的时候要注意不要把探头挨着管壁,还有就是要听超声时候的声音,一般清脆刺耳的就没问题,不然就可能处泡沫,还有就是一定要把探头伸到液面下,并且要稍微深一点



2024-11-11 11:02:11

注意不要过度破碎

2024-11-12 11:04:19

注意功率,放的位置,时间,间隔时间

2024-11-12 20:29:31

泡沫出现说明你的功率大了,功率100即可,探头在液面5厘米左右最好,超声波是纵波,此时的位置能最大程度的利用超声波,一般我选择破3停3,时间太长可能会使蛋白变性,另外,装菌体的容器置于冰水混合物而不是碎冰中,超声发热快,只放冰很容易造成容器周围形成空隙,将裂解的菌液对着光看,如果边缘透亮则说明破解好了

2024-11-13 04:17:39

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