我做实验时，一批某基因KO的小鼠基因鉴定是纯合子，PCR结果也显示基本敲除很干净。但是跑WB时发现,与WT小鼠相比，KO小鼠这个基因的蛋白表达量反而更高。抗体是新买的，重复了几次WB，结果都差不多，这是什么原因？接下来我要怎么解决？求赐教，万分感谢！
原因肯定是这两种鉴定里的一种做错了或者有漏洞呗，不说详细点也不知道问题出在哪
你重复了几次WB，PCR重复了几次呢
重复试验，排除干扰。如果还是这样，可以联系购买公司确认敲除效果。
如果是确定的纯合子的话，WB结果有误差我可以肯定，毕竟WB也不是很准确的定量，看一下你的抗体特异性如何。换个抗体试试，最好单抗吧
这个问题最终是出在抗体上，不能说抗体质量不行。因为在基因敲除的过程中大部分是移码突变，导致提前终止，因此总会有一段肽段翻译出来，如果抗体的抗原位点刚好就在这段肽段或着抗原是整个蛋白，那么有可能就会有条带，但是发出来的带应该会小一些，具体可以看下小鼠的敲除信息，看看翻译出多大的肽段。
