我准备检测RIP1蛋白的磷酸化水平,但是市面上没有磷酸化RIP1抗体,那么如何检测RIP1的磷酸化水平?我看文献上讲用的是IP的方法,但是沉淀后的免疫复合物如何去跑电泳呢?是分别用RIP1的抗体和磷酸丝氨酸的抗体做一抗吗?而且查了资料和文献,磷酸丝氨酸的分子量也没有?难道是先做RIP1的电泳,然后洗脱,然后在同一个蛋白大小的位置再去检测磷酸化?请高手明示!
提供个方案供参考。用RIP1蛋白的抗体做IP(需要确定你的抗体适合做IP),免疫沉淀复合物加loading buffer煮样后,进行SDS-PAGE,Western用泛抗丝氨酸磷酸化抗体,检测RIP1蛋白对应分子量位置的条带情况。间接说明RIP1蛋白的磷酸化
磷酸丝氨酸的抗体做一抗,只要是发生丝氨酸磷酸化的蛋白都能被检测到,不针对特异性的蛋白,而是针对丝氨酸发生磷酸化的序列
用同位素吧,32P,这个比较靠谱。anti-ser没有好用的,现在好用的抗体只有针对酪氨酸磷酸化的。还可以打质谱。
ub贴在RIP蛋白的赖氨酸残基上形成泛素化,western 检测可见分子量不等的ladder,所以你要剪的条带是RIP蛋白分子量以及其分子量以上的地方