2024-09-05 09:21:15

有没有人用过targetscan?

我在targetscan上分析了我们感兴趣的microRNA和某段mRNA存在“poorly conserved”结合位点,但是没有“conserved”的位点,这样的分析结果能继续往下验证二者的关系么?还有,targetscan的分析结果怎么看它的可靠程度?求用过targetscan的高人赐教!


回答 0 评论
您已邀请来回答问题
生物信息学×

2个回答

TargetScan只是预测,如果想验证恐怕还是需要做实验

2024-09-05 11:36:16

一般来说conserved的site会相对可靠,但并不绝对。TargetScan只是预测,最终还得实验验证。另外,targetscan会给出binding的score,一般score越高,binding越强。另外,你也可以试试其他的方法,比如PITA,pictar等。如果多个算法都支持binding,那就值得去做实验验证了。


2024-09-05 11:47:22

你的回答