我在targetscan上分析了我们感兴趣的microRNA和某段mRNA存在“poorly conserved”结合位点,但是没有“conserved”的位点,这样的分析结果能继续往下验证二者的关系么?还有,targetscan的分析结果怎么看它的可靠程度?求用过targetscan的高人赐教!
TargetScan只是预测,如果想验证恐怕还是需要做实验
一般来说conserved的site会相对可靠,但并不绝对。TargetScan只是预测,最终还得实验验证。另外,targetscan会给出binding的score,一般score越高,binding越强。另外,你也可以试试其他的方法,比如PITA,pictar等。如果多个算法都支持binding,那就值得去做实验验证了。