2025-01-20 11:54:11

如何解决SDS-PAGE跑胶问题?

最近一年来只要跑胶就有如图的问题,图是网上搜来的,我的问题和该图一模一样(第6道渗下去的问题),所以就没照相。 望遇到过同样问题并顺利解决的各位不吝指教!我快要疯了,目前实验主要是western,出这种问题非常痛苦!想了很多方法也没有解决。

图片1.png

回答 0 评论
您已邀请来回答问题
蛋白质技术×

5个回答

很简单的问题,原因也很简单,做胶的时候不注意细节。

这种情况一般出现在拔底面spacer(大板胶通常有底部的封条)和样孔梳子的时候。原因有四种可能:

  1. 1. 梳子过紧。梳子或底边spacer的宽度和两边spacer的宽度有极细微的差别(质量不合格或不配套),使得勉强用力拔梳子的过程中,造成玻板的错动。通常除梳孔漏样外,玻板底部往上会出现局部的气泡。

  2. 2. 制胶时间过长或者制好后长时间不用却未采取保湿的措施。实际上这两者仍然造成问题1的麻烦,拔梳子时连带错动玻板。

  3. 3. 进样的时候,加样枪头深入加样孔过深从而挤开玻板,造成微小错动。采用拉长的进样枪头,同时仍要注意不能插入过深。

  4. 4. 玻板质量勉强合格。国产玻板不能做到非常光滑,使得稍微用力玻板就会松脱,产生错动。与胶体是否混匀无关,与水质无关(一定要用DDW,这是毫无疑问,不必经常提及的最基本的注意事项),与玻板是否洗净或磨损无关(与梳子是否磨损有点关,因为塑料制品磨损后不一定变薄,经常会边缘起皱增粗;同样使得本来一致的间距,由于梳子增粗,拔出阻力增大,极易造成微小错动)就本图而言,实验者最主要的弊病在于加样枪头过分深入,原因是中间孔道漏样,即非常可能就是加第6道时过分用力。若漏样出现在两侧,则主要问题在于拔梳子时的错动。不可能是加样器刺穿底部(假设加样器尖端比spacer间距小),如果是刺穿不会出现在堆积胶和分离胶分界位置一条线的漏样,而只会是一个点的汇集(刺穿点);因此如果是刺穿,更核心的问题是刺穿的同时枪头将玻板挤开,造成微小错动。因此,如果你总是出现类似问题,请注意你每个实验细节。不要让胶干掉,凝固后尽量立即使用;即使不立即使用,请先拔去梳子和底部spacer,然后注意保湿。拔梳子请在液体中操作。加样时用拉长且更细的进样枪头;没有条件,也不要拼命拿枪头往下挤。




2025-01-20 12:01:20

因为你的胶板没做好,当然跑任何人的样品都会漏样。“效果还可以”,真的不知道你是怎么判断的,如果样品漏掉,基本该lane就作废了,一组实验如果是一个重要的ctrl或者positive group,一次结果就报废了。其实,关于玻板要洗干净之类,我懒得去提;这是最基本的常识,应该不用特别提醒才对。如果这点做不到,想做好实验或者说让实验很稳定,我想是很难的,玻板未洗净的坏处很多。尽管玻璃看似平滑,但是一些细微的凹陷处会凝结肉眼无法分辨的胶颗粒(摸上去疙疙瘩瘩),其坏处是,在该部位极易导致不均匀的胶块,样品经过该处或电泳散热不好,条带变形。如果是RNA的超薄胶,胶板的颗粒会导致局部巨大气泡,非常难于清除;蛋白胶也会导致一些小气泡的产生。懒得提不等于这点不重要,不干净=不光滑,玻板不光滑直接影响粘粘的牢固程度。顺便说一句:因为玻板干净很重要,我从来不会拿公用的。我会自己keep一套自己专用,每次自己用洗洁精(非洗衣粉,洗衣粉洗不干净玻板)清洗,放在自己的bench上晾干——这些都是常识。实际上,上一次回答中我就已经告诉过你这个问题的解决方案,你的核心目的是尽量减小板间错动。那么灌胶的时候,先插好梳子再夹到胶槽上——再灌胶。如果你要问梳子插上去了怎么灌胶?先插一半总可以吧。当然压胶液体的清除相对麻烦,如果是异丙醇似乎必须清除干净,那么你可以使用台式真空泵;如果没有多用几张吸水纸。然后灌堆积胶,堆积胶灌好后,再把梳子全压进去。然后电泳缓冲液中拔梳子(比水更好,有SDS润滑)。至于你觉得那个正确的答案:他唯一可行的地方就是干净的玻板;磨损小的玻板==光滑,干净==光滑,玻璃介质表面光滑的时候黏附最紧——中学的物理常识。PS:RIPA用过<3次,均未出现你说的现象。不再纠缠这个问题了,哎!


2025-01-20 12:22:44

其实大家说的都有道理,但该问题的发生根本还是在制胶过程。如果你观察细致的话,就可以发现,某个泳道漏下来,也只是漏到了积层胶与分离胶交界的部位,而且你若是低电压压的话,到了分离胶情况就有所好转。所以根本原因还是用来压平分离胶的液体没有清除干净。解决办法:分离胶制好后,不管是用水压(我就用水)还是别的什么,再灌积层胶前,是很难清除表面那一层的。所以,只要在灌积层胶之前,先取少量胶液灌进胶板,迅速轻轻左右晃几下,让液体充分沾上分离胶上层,再把这些胶液去掉,然后再正式灌满积层胶,插进梳齿。问题就解决了。我说的很复杂,其实很简单,就是先用积层胶的液体润一下就行了。我的经验是积层胶的AP和TEMED先不加,去水,再加AP和TEMED,混匀,第一次灌少量,晃几下,去除,再正式灌满。整个动作要快要轻柔。试试吧,肯定可以。


2025-01-20 13:37:29

看图后有以下意见:

1 第6道加样时可能是加样器尖部刺穿了胶底部,所以漏了。

2 蛋白样品没有和上样缓冲液充分混合。

3 制胶时,要充分混匀,使得胶的质地均匀。




2025-01-20 13:55:32

补充一下玻璃板检查下有没有问题,还有就是配胶我们实验室都是用的超纯水




2025-01-20 14:14:01

你的回答