在TCGA数据库中,临床数据,
1.当做生存分析的时候,其生存时间是最后的随访时间?还是直接到死亡时间?
2.肿瘤状态中,TCGA临床数据中,患者的肿瘤状态,TUMOR FREE和Not Available和with TUMOR都是表示什么状态?NOT Not Available 是不可用的吗?
1,如果样本的状态是“Dead”,生存分析时候用死亡时间;同样的,如果样本状态是"survival",那就用最后随访的时间;
2,患者的肿瘤状态中的turmor free表示到随访截至时间为止患者是无瘤状态;with turmor表示术后又产生了新的肿瘤。 not avivalbe说明到随访截至时间为止,该患者的肿瘤状态的临床信息未收集或不明确。
关于生存分析,我可以列个图给大家看看
这种是定期随访的结果,实际统计的时候并不是按照患者一一对应,而是只统计在这一随访时刻的生存和死亡的患者数,计算一下survival rate。每个时期的survival rate连成线就如上图
如果在随访截至时间时候出现了肿瘤,那么仍然会有一段tumor free time的,在TCGA数据中有些类型的肿瘤把这个单独给出了,所以你需要看看最终的状态是否是出现肿瘤