大量重复序列是否会影响测序结果？

有一个基因序列，全长1200bp左右，其中有一个40bp的重复序列，在该基因内部重复出现了8次，但是两次测序结果不一致，其中一次测序缺失了一个完整的重复，即内部重复只出现了7次，希望向各位高手咨询一下，造成这个情况的原因是测序的问题还是T克隆的问题呢？谢谢。

基因工程

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有种现象就叫做 copy number variation (CNV)，其实这个值得研究下，目前已经发现不少疾病与CNV相关

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2024-11-20 19:24:24

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0bp一般不太可能是测序错误，有可能这个就是tandem dup的时间吧，在不同个体之间的差异性

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2024-11-20 20:52:41

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直接PCR一下，看看长度有没有变化

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2024-11-20 21:03:15

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测序结果都有峰图，建议看一下图，在差异位置峰值差异大不大就可以判断测序结果准不准了

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2024-11-21 16:51:20

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那得看你设计的引物落在哪个区域吧，是否报告了重复序列

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2024-11-24 11:39:54

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设计一个引物...ppcr一下...看看在目的条带对不对，大片段重复序列有的时候测序仿佛是会出现一下小偏差的。

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2024-12-12 12:35:08

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