2024-11-23 17:12:25

有几段蛋白序列,每个大约300bp,如何找它的SNP?

有几段蛋白序列,每个大约300bp,我如何找它的SNP。我想根据蛋白序列的某个区域(比如1-30,90-150等),找它所对应的SNP有哪些,不知如何找到呢?我对生物信息不是很了解,还望各位能给个思路。在下先谢了


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生物信息学×

2个回答

1 你把蛋白序列对应的核酸序列找到;

2 根据核酸序列在做BLAST (对dbSNP数据库http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/snpblastByChr.html);

3 结果中,你可以得到你的序列上所以已知的SNP。


2024-11-23 18:40:57

你可以根据你的蛋白所属的基因找到这段基因的全长系列,在ncbi库中同时提供了蛋白质系列,你在到了你的氨基酸系列也就可以找到相应的核甘酸系列,在这个基础上就可以找到相应的SNP


2024-11-24 10:47:05

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