老外的文章，总蛋白和磷酸化蛋白一般都会做WB。对结果的解读，以下意见，供参考：（1）内参一致，总蛋白不变，磷酸化蛋白表达升高或者降低：说明经过某种处理（外部操作，抑制剂，上游蛋白基因敲除或者siRNA等）后，对该蛋白（及其代表的信号通路）的活性产生影响（促进或抑制）；（2）内参一致，总蛋白升高或者降低：说明经过实验组的处理方法能够诱导总蛋白的表达或者降解。至于磷酸化活性的变化，和总蛋白的表达高低有关，该种处理方式可能同时影响该蛋白的表达与磷酸化形式，对该蛋白代表的信号通路发挥作用。抛砖引玉，请一起分享你们的见解。

蛋白质磷酸化：指由蛋白质激酶催化的把ATP的磷酸基转移到底物蛋白质氨基酸残基（丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸）上的过程，或者在信号作用下结合GTP，是生物体内一种普通的调节方式，在细胞信号转导的过程中起重要作用。磷酸化(由激酶催化)和去磷酸化(由磷酸酶催化)是控制细胞周期的关键.它们都被用来控制调控途径自身活性和执行调控途径决定的底物活性.

磷酸化和去磷酸化是一种分子开关形式。一些蛋白平时处于失活状态，必须被激酶磷酸化之后才才可以发挥活性，进一步转导各种生命过程。而有些正好相反，某些蛋白磷酸化时是失活的，必须经过磷酸酶去磷酸化才可以激活。

个人理解，一般通路蛋白是要做磷酸化的，跟总蛋白比较。但是，如果测得总蛋白都已经减少或者增加了，那就没必要再测其磷酸化水平了吧。